本發(fā)明涉及微流控芯片技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種3D微流控芯片模型、3D微流控芯片及其制備方法和應(yīng)用。本發(fā)明提供的3D微流控芯片模型，包括模具2和位于模具2底部的底座1；所述底座1包括底板1？1和側(cè)壁1？2；所述模具2包括本體2？1和設(shè)置于本體2？1下表面的若干凸起2？2；所述凸起2？2的高度大于等于所述側(cè)壁1？2的高度。采用本發(fā)明提供的3D微流控芯片模型能夠成功構(gòu)建3D微流控芯片，可以用于觀察土壤生物地球化學(xué)界面動(dòng)態(tài)變化，能夠?qū)崿F(xiàn)多個(gè)不同樣品的同時(shí)培養(yǎng)，能在短時(shí)間尺度和有限體積的分析物上進(jìn)行元素含量、酶活性定性或定量檢測(cè)。